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潜山市农业科学研究所作为一家社会公益型新型研发机构，横向合作单位有中国热带农业科学院、江南大学ope体育、海南大学、安徽省农业科学院ope体育、安徽省循环经济研究院、安徽农业大学、北京中合金诺认证中心种植。
潜山市农业科学研究所内设综合管理办公室、产学研合作指导科、科技产业管理科种植知识、财务科ope体育。下设12个试验站（场），试验示范基地面积超过2.3万亩，并通过技术成果转化的方式参与投资4个产业经营公司。
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